事业单位

1、 水文局

2、 长江科学院

3、 水利部中国科学院水工程生态研究所

4、 陆水试验枢纽管理局

5、 汉江流域治理保护中心

6、 长江勘测技术研究所

7、 澜湄水资源合作中心

8、 河湖保护与建设运行安全中心

9、 网络与信息中心（长江档案馆）

10、宣传出版中心

11、人才资源开发中心

12、机关服务中心（局）

13、长江医院（血吸虫病防治监测中心）

14、长江流域水土保持监测中心站

15、长江水资源保护科学研究所

企业单位

1、 长江水利水电开发集团（湖北）有限公司

2、 长江设计集团有限公司

3、 汉江水利水电（集团）有限责任公司（丹江口水利枢纽管理局）

4、 南水北调中线水源有限责任公司

5、 湖南澧水流域水利水电开发有限责任公司